Dados completos

Como tratar os dados

Quando for escrever um artigo copiar os dados abaixo para a pasta do artigo e recomeçar a tratar os dados do inicio. Ou então fazer o tratamento estatistico todo no mesmo conjunto de dados. De qualquer maneira não trabalhar sobre este conjunto de dados e fazer sempre a sua cópia para pasta do artigo respectivo.

Este ficheiro inclui 2 classificações (simples e complexa)

dados 2002 completos - excel

dados 2012 completos - excel

dados 2002 e 2012 juntos e completos

duvidas de LABORATÓRIO

Porque é que se repetem tantas leituras como as do potássio, cálcio, Niquel, etc?
- As repetições, frequentes, dos elementos que refere devem-se, provavelmente, ao facto de as leituras serem muito altas e ser necessário diluir para que as mesmas se façam dentro do intervalo de calibração (quando passar os dois dias connosco, vai perceber melhor).

No ficheiro de 2002 Cl são cloretos

Azoto total é azoto orgânico (98% do azoto total do solo)

Técnicas laboratoriais utilizadas estão confirmadas em papel.

Nutrientes com mais de 1 leitura apresento a média

dados completamente tratados

Terminei hoje de tratar todos os dados e tenho os valores finais para aplicar em artigos

Problemas Estatisticos

Os dados não são normalmente distribuidos mas, o que é pior, não têm homogeneidade de variâncias entre eles o que obriga à transformação dos dados. O problema é que não estou a conseguir transformá-los correctamente para os tratar e já tentei 'n' situações distintas nos ultimos dias.
Com um tratamento os dados têm diferença estatistica, com outro traamento não o têm.

V artigo - updates

Depois de ter feito a análise estatistica para as amostras de 2011/2012 apercebi-me que, para que os dados analisados tenham validade, se as quero comparar com as amostras de 2001/2002 tenho também de fazer o tratamento estatistico destas últimas pois doutra maneira nunca saberia se as diferenças são estatisticamente válidas ou não.

No re-tratamento apercebi-me de várias situações:
- os dados de 2001/2002, tal e qual como acontece com os dados de 2011/2012, não são, na sua larga maioria, normalmente distribuidos e terão de ser, também eles, completamente re-analisados e apenas posteriormente poderei fazer a comparação de 2001/2002 --> 2011/2012;
- Terei de re-escrever algumas partes do artigo para reflectir os novos valores de 2001/2002 pois há a alta probabilidade de não baterem certo com os da tese de doutoramento do prof. ZM devido a terem aplicado uma ANOVA (assumido, portanto, a normalidade dos dados).

dúvidas

- ANTIGUIDADE EM REGADIO:
1 - Como é que o professor soube estes dados no primeiro levantamento amostral?
R: Por informação de técnicos da Associação de Regantes que estavam ao serviço desde o inicio do projecto de rega. As zonas foram marcadas de forma grosseira, sem grande rigor.

2 - No segundo levantamento este dado não existe. Como proceder?

R: No segundo levantamento, as zonas com diferentes idades em regadio são as mesmas. Basta juntar 10 anos a cada uma das diferentes zonas de antiguidade.

Estou a assumir que a antiguidade em regadio está ordenada segundo a sua tese mas talvez consiga obter estes dados dos ficheiros SPSS que a Ana me irá enviar. Estou a assumir:
1: < 15 anos
2: entre 15 e 25 anos
3: > 25 anos
R: Sim

- Quanto aos dados do primeiro levantamento amostral:
Não terei de fazer qualquer tratamento estatístico a estes dados certo?
bastando-me utilizar os RESULTADOS que já se encontram tratados e explícitos na sua tese.
É isso?

- O cloro de 2002 tem equivalência com os 'cloretos' de 2016? (ou seja, é tudo 'Chlorine'?)

5 artigos para escrever

I: Study and comparison of some geo-statistical methods for mapping macronutrients in the Mediterranean basin

N, P, K, Mg, Ca, (falta apenas o S nos macronutrientes secundários)

Tentar perceber como funciona, ao nivel de geo-estatistica e estatistica classica, o estudo destes elementos e escrever um artigo em volta dos diferentes métodos geo.estatisticos, melhores variáveis dependentes, etc.

II: Evolution of macronutrients under specific cropping managment systems (irrigation vs rain-fed)

Pegar nos macronutrientes em si e avalia-los conforme os métodos descritos no artigo I.

III: Evaluate the spatial and temporal variability of cation micronutrients of the soil in a Mediterranean irrigated perimeter field

Pegar no Fe, Mn, Zn e Cu (a sua variabilidade está ligada ao pH)

IV: Spatial distribution of Ni, Na and heavy metals in mediterranean soils: the case study of the Caia Irrigation Perimeter

Pegar no Na, Ni , Cr, Cd, Pb

V: Assessing space and time variability for some edaphic characteristics of Mediterranean soils

Pegar no pH, condutividade e MO.
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(re-)tratamento de dados

Dados de 2002 e de 2016 (re-)tratados para efeitos da tese de doutoramento.

Falta ver o que fazer em relação aos dados incongruentes (duplicados, inexistentes, etc)

3 artigos para ZM

Mais sustentabilidade no artigo (ligar o artigo a sustentabilidade). 5 parágrafos com sustentabilidade.
Referências bibliográficas recentes ligadas a sustentabilidade (social, agrónoma)
Redigir o artigo
(O feedback é de que o artigo não se coaduna com a revista)
Editar o texto.

tese Lic. DONE

estou só a aguardar feedback

revisão 1º par de Dossiers - Bases de troca + CTC

Estou a rever os 1451 valores das bases de troca e CTC para a tese de Lic. pois tinha várias incongruências (a maioria já descobri o que é e está a ser resolvido).

Valores revistos.

Escrita da tese

Começou, oficialmente, hoje.

Reunião prof. ZM

Dúvidas que ficaram resolvidas:

• Perguntar se o prof tem a legenda do ficheiro de 2002 já que esta não se relaciona com o ficheiro do prof. LL e é de difícil relacionamento com a tese de doutoramento (ex: ver siscul na tabela e tese (pag. 374) e o posfig) --> Resolvido. Havia um ficheiro com a legenda.
• Perguntar se tem as shapefiles dos dados de 2002 (já que estão na sua tese de doutoramento). --> Tenho isto e mais uma carrada de shapefiles de cartas de solos

Próximo passo

Fazer os cálculos dos valores finais dos componentes químicos do solo (no mínimo para a tese de licenciatura) do ficheiro Excel de 2012 para poder fazer o join final em SIG e comparar os valores de CTC (e outros que sejam pertinentes para esta tese). Ver MUITO BEM com o prof. ZM quais são TODOS os parâmetros a comparar pois basta faltar 1 para ter de refazer todo o trabalho.

Perguntar se o prof tem a legenda do ficheiro de 2002 já que esta não se relaciona com o ficheiro do prof. LL e é de difícil relacionamento com a tese de doutoramento (ex: ver siscul na tabela e tese)

Perguntar se tem as shapefiles dos dados de 2002 (já que estão na sua tese de doutoramento). Se não tiver quem pode ter isto? A prof. S?

Coordenadas - RESOLVIDO :D

O problema das coordenadas ficou resolvido com a ajuda preciosíssima da prof. S.
O problema está numa transformação de coordenadas marada.

Tenho agora o projecto em Lisboa_Hayford_Gauss_IGeoE
- Os dados de 2002 têm de estar em: GCS_European_1950 (se não encontrar este sistema de coordenadas colocar o EPSG que é 4230) e, posteriormente, serão TRANSFORMADAS (com a opção project) em Lisboa_Hayford_Gauss_IGeoE (ver imagem abaixo mas apagar a 1ª linha da transformação. A que interessa é apenas a 2ª linha). A transformação tem de se carregar pois não aparece por si só (é um shapefile normal);
- Os dados de 2012 têm de estar em: Lisboa_Hayford_Gauss_IGeoE

Outras informações importantes:

• Os dados de laboratório relacionam-se com os dados recolhidos em campo através do campo 'Amostra' do ficheiro de 2012;
• Quando fizer o spatial join vou a pasta onde tenho os ficheiros SIG e o ficheiro .dbf é a tabela em excel que posso abrir e gravar noutro lado para aproveitar para fazer estatistica classica;
• Verificar as coordenadas dos outliers com o ficheiro solo.xlsx e refazer o trabalho que fiz com a professora Susana  FEITO REFAZER pois tenho de alterar o core das tabelas e refazer estes passos.

Problema das coordenadas de 2002 (quase) resolvido

Para resolver o problema tive de converter os minutos e segundos da longitude e latitude das coordenadas do ficheiro excel (/60 e /3600 respectivamente) e somar estes valores com os respectivos graus.

Consigo agora visualizar as coordenadas no sitio correcto mas existe o tal desfazamento de 313m entre as coordenadas de 2002 e 2012.

Ver isto com a professora S. quarta-feira.

Lembrei-me agora

O R. utilizou análise matemática/estatística no trabalho dele? e geoestatistica?

CONFIRMAR ISTO!

Realmente não fez rigorosamente nada disto (fez a diferença de valores e disse se aumentava ou diminuia e, posteriormente, diz que utilizou estatística em SPSS mas não comunica claramente os resultados alcançados e é muito óbvio que não foi ele quem fez esta análise caso contrário teria expandido mais sobre o assunto limitando-se a apresentar resultados.

geoestatistica'não existe neste trabalho.

em SIG são apresentados os mapas de:

• localização das amostras (cerca de 500) (1 mapa);
• Evolução dos teores de MO (2 mapas: 2002 e 2012);
• Área de sequeiro e regadio (1 mapa).

O R. dedicou-se mais à escrita da parte de recolha das amostras pois foi o que lhe deu mais trabalhoe o que lhe roubou mais tempo.

Começar a escrever

Com base nos artigos que já li estou pronto a começar a escrever parte da tese de Lic. Enquanto a escrevo vou lendo o ‘Geostatistical_Analyst.pdf’ pois é isto que me ensina que métodos geoestatisticos utilizar e porquê - muito embora, dos artigos que li, o método a utilizar no caso da CTC é o de fuzzy kriging com outras variáveis do trabalho - e como os testar no caso específico do âmbito de estudo do meu trabalho. Quando acabar de ler este documento já tenho de ter os dados em SIG preparados para os testar pelo que tenho de me encontrar com a prof. S. ASAP.

90% da tese

Segundo o prof. ZM não há problema em que o conteudo da parte teorica do meu trabalho de licenciatura seja identico ao 'Efeito da prática continuada do regadio sobre o complexo de troca do solo' de janeiro de 2009 desde que, ao longo do meu texto, faça referência a outros artigos para além do dele.

SIG

Tenho agora 3 ficheiros importantes:
1 - dados do prof. ZM
2 - dados do prof. LL
3 - dados do R

Tenho dos fazer coincidir em GIS. Falar com a prof. S sobre isto.

Desvio entre as coordenadas dos ficheiros:
SD-lat e long do Caia.xlsx e LL-Dados de amostras - 2 par de dossiers COMPLETOS.xlsx
313m na vertical

As coordenadas do ficheiro RN-2002 - dados completos.xlsx não batem certo com nenhum dos ficheiros anteriores
Preciso de fazer com que as coordenadas de 2002 e 2012 batam certo para poder comparar os parâmetros em análise.

2ª leva de dossiers

Nas ultimas 2 semanas estive a passar os dados da 2ª leva de dossiers (Dossiers com as fichas de recolha de amostras onde se encontra a localização, declive, profundidade, cobertura do terreno, etc) mas o prof. LL arranjou-me ontem os dados em excel. Perdi 2 semanas mas ganhei uns meses valentes em transcrição de dados.

Tenho agora de rever estes dados todos - muito embora seja quase garantido que estão, pelo menos, a 99% - para os começar a utilizar em GIS

O problema das coordenadas

Para comparar as análises de 2002 com as de 2012 tenho de ter um parâmetro em comum mas, até à data está difícil de o arranjar devido a incongruências nos números das amostras. O melhor é relacioná-las via posicionamento mas deu-se o problema das coordenadas de 2002 estarem no formato latitude/longitude e as de 2012 estarem em Hayford Gauss Militar e quando passei as coordenadas em HGM (amostras 2012) para lat/long e as comparei com as de 2002 estas não batem certo (nenhuma coordenada se reflecte nos ficheiros de 2002)
No QGIS fiz:

• criei um projecto com CRS HGM (EPSG: 20790)

• criei uma layer também nesse sistema onde introduzi as coordenadas manualmente (plugin que instalei)

• alterei o CRS dessa layer para o de lat long (EPSG: 4326)

• exportei as suas coordenadas para a tabela de atributos

• verifiquei e não bate certo com o que existe

Tentei ainda fazer:

• criei um projecto com CRS lat long (EPSG: 4326)

• criei uma layer com CRS HGM (EPSG: 20790) onde introduzi as coordenadas manualmente (plugin que instalei)

• …

• O QGIS não cria o ponto...

As coordenadas que obtive para as amostras:

• 1: -7.153467; 38.813488

• 49: -7.134580; 39.008769

• 103: -7.127080; 38.999602 (ou -7.827760; 39.552120 pois inverti as coordenadas (x;y) do ficheiro prof._Susana.xlsx não fosse esse o erro mas também estes novos valores não aparecem em qualquer dos ficheiros prof_Ze_Manuel.xlsx ou 'lat e long do Caia.xlsx')

Não percebo o que possa estar errado mas não encontro nenhuma correlação entre as coordenadas que, supostamente, deveriam bater certo (ou muito aproximadas) em todos os ficheiros. Fico sem perceber como é que o Ricardo comparou, em termos de MO, os dados de 2002 com os de 2012 se as coordenadas não batem certo.
Claro que o mais provável é as coordenadas baterem certo e eu estar a fazer uma azelhice tremenda no QGIS.
Pedir ajuda à prof. Susana.

Amostras em falta e duplicados

As análises em falta são as:
- 34
- 35
- 49
- 71
- 258
- 308
- 372
- 805
- 931
- 967
- 1023
- 1208
- 1242
- 1261
- 1285
- 1327
- 1331
- 1348
- 1349

As análises em duplicado são:
- 12: no lote 1 e lote 4
- 64: no lote 1 e lote 6
- 121: no lote 6 e lote 10

Licenciatura e Doutoramento

• 3 Dossiers com os as análises de solo:
• Passei todos os valores para o excel.
• Há valores omissos e incongruências
• Tratar das incongruências aquando da revisão de valores
• Os valores de MO foram confirmados +2 vezes depois de redigidos e calculado o seu valor final automaticamente
• Os valores de CTC foram calculados automaticamente. Revê-los aquando do tratamento da incongruência de alguns parâmetros.